Proteins by subfamily and organism for eukaryotes

speciesphlyogroup
G lambliaprotist 12      1           2   6G lamblia
E histolyticaprotist 11 2      2        12 2 11E histolytica
L majorprotist     3 1   1 1 23    2 2116L major
T bruceiprotist     2 1   1 1 22    1 2 12T brucei
T cruziprotist     3 1   2 2 32    4 3 20T cruzi
P falciparumprotist111  1 1  11    2      1 10P falciparum
P vivaxprotist111  1 1  11    2      1 10P vivax
P yoeliiprotist111  1 1  11    2      1 10P yoelii
T parvaprotist111  1 1  11         1 1 9T parva
T annulataprotist111  1 1  11         1 1 9T annulata
C reinhardtiiprotist121 11     31   1  1 211 16C reinhardtii
C merolaeprotist21  11 1        1 1111 1 12C merolae
D discoideumprotist211 2  1 112   11 1312 2 22D discoideum
E cuniculifungi 1  1    1          11 1 6E cuniculi
C neoformansfungi1111 1 1 112    51 311   21C neoformans
S cerevisiaefungi221  1 1 112    21 111   17S cerevisiae
S bayanusfungi221  1 1 112    21 111   17S bayanus
S castellifungi231    1 112    2  111   16S castelli
S mikataefungi221  1 1 112    21 111   17S mikatae
S paradoxusfungi221  1 1 112    2  111   16S paradoxus
Y lipolyticafungi221  1 1 112    22 211   19Y lipolytica
D hanseniifungi221  1 1 112    22 211   19D hansenii
A gossypiifungi221  1 1 112    21 111   17A gossypii
S pombefungi2 21   1 132    23 111   20S pombe
C albicansfungi432  2 2 224    42 222   33C albicans
C glabratafungi221  1 1 112    21 111   17C glabrata
K lactisfungi221  1 1 112    21 111   17K lactis
K waltiifungi221  1 1 112    21 1 1   16K waltii
S nodorumfungi2111 2 1 112    432212   26S nodorum
U maydisfungi111  1 1 112    31 211   17U maydis
A nidulansfungi1211 1 1 112 1  42 212   23A nidulans
N crassafungi1111 1 1 111 1  333312   25N crassa
C globosumfungi1111 1 1 111 1  342212   24C globosum
M griseafungi1111   1 111 1  412311   21M grisea
A thalianaplant6313 121 1111 6 55 213 2 45A thaliana
O sativaplant3322 211 1111 8 45 114 2 43O sativa
C intestinalisinvertebrate10107526 2  2321      24 5 61C intestinalis
C elegansinvertebrate31121  1  1211    6211 4 28C elegans
B moriinvertebrate111      11121      11 1 12B mori
A melliferainvertebrate522511   11382    4 4  6 45A mellifera
A gambiaeinvertebrate111111 1 11232    211  1 21A gambiae
D melanogasterinvertebrate43131  3 11121    211  1 26D melanogaster
D reriovertebrate6571613 21 641 1  2 1116 1 74D rerio
T nigroviridisvertebrate31243111211322  1 1121 1 34T nigroviridis
F rubripesvertebrate16291510114311372  3 2124 3 90F rubripes
X tropicalisvertebrate14111513114 1351642  4 232414 110X tropicalis
G gallusvertebrate24761131 322221    2115 5 60G gallus
M domesticamammal22334111311211  1 1114 2 36M domestica
C familiarismammal725138142421511  2 1223 3 69C familiaris
B taurusmammal43254122111211  1 1112 2 38B taurus
R norvegicusmammal33224111 21111  1 1114 3 34R norvegicus
M musculusmammal2732611 421421  1 2314 6 53M musculus
P troglodytesmammal42254132123211  1 1124 4 46P troglodytes
H sapiensmammal53264132133241  2 1114 4 53H sapiens
speciesphlyogroup
  • click on count for listing of members
  • click on subfamily column title for description page
  • mouseover organism row name for full name and description, click for description page
  • other views: model eukaryotes, all eukaryotes, archaea, prokaryotes
  • subfamily assignment as bitscore >100 to hmm model as described in Flaus et al, NAR v34 p2887, 2006
 < back to previous page
<< snf2.net homepage